明初，长泰县城区内设"坊"、城区外设"里"，里下设"图"，每里辖数图。全县设1坊、 8里、36图。明嘉靖元年（1522年）缩为11图（一说缩为12图，钦化里辖2图）;仁和里改人和里，敦信里改彰信里，永福里改旌孝里，丰成里改方成里。

民国22年（1933年），长泰县划分5个区公所∶ 一区（今武安）、二区（今岩溪）、三区（今陈巷）、四区（今枋洋）、五区（今坂里）。共辖20个联保、221个保、1257甲。民国29年，"联保"改为2个镇5个乡;武安镇、岩溪镇、仁化乡、恭信乡、枫洋乡、甘棠乡、坂里乡，乡下共辖 63保645甲。当年12月，武安、岩溪两镇改称乡。

1949年9月，长泰县解放，保持原有的1 镇6乡57保。1949年9月25日，长泰县人民政府成立。随之，全县行政区划为4个区，下辖57个保。1950年，废除保甲建制，实行区辖村，将区下辖的保改称为村。1951年，实行区辖乡镇建制，全县4个区共辖48个乡（镇）。

1958年2月，撤区并乡，全县划为1个镇和17个乡。即∶城关镇和城关、京兰、积山、夫坊、树农、后坊、山重、新吴、岩溪、石铭、湖珠、枫洋、林墩、科山、美宫、正达、坂里乡。9月，实行人民公社化，全县设红星、共进、红旗、卫星、火箭等5个人民公社，下辖51个大队。

1984年10月，政社分开，大队改为行政村，农林场的大队改为作业区或工区。全县设2个镇∶武安镇、岩溪镇;设4个乡：人和乡、陈巷乡、枋洋乡、坂里乡;设4个场;古农农场、亭下林场、岩溪林场、良种场。其下共转54个行政村和14个作业区（站）819个村民小组 （作业组）和6个城镇居民委员会，包括625个自然村（居民点）。

1990年，全县有2个镇、3个乡、4个农林场【福建省国营古农农场（1957年建场）、福建省国营长泰岩溪林场（1957年建场）、福建省国营长泰亭下林场（1960年建场）、长泰县良种场】，下辖54个建制村、14个作业区（站）、6个居民委员会、708个村民小组。

2007年底，全县有武安镇、岩溪镇、陈巷镇、枋洋镇、坂里乡、国有古农农场（银塘办事处）、马洋溪生态旅游区、长泰经济开发区、林墩办事处。下辖57个村民委员会、13个作业区、9个居委会、766个村民小组、109个居民小组、647个自然村。还有2个国有林场、1个县办良种繁育场。 

2019年，长泰县辖武安镇、岩溪镇、陈巷镇、枋洋镇、坂里乡、国营古农农场（银塘办事处） 6个乡镇（场）、1个省级经济开发区（长泰经济开发区）、1个市级工业区（林墩工业区）和1个市级生态旅游区（马洋溪生态旅游区），共辖58个建制村、26个居委会。还有2个国有林场、1个县办良种繁育场。 

2021年，撤销长泰县，设立漳州市长泰区，以原长泰县的行政区域为长泰区的行政区域。